Webinar Hakkında
Sunucu
Yrd. Doç. Dr. Hatice Ülkü Osmanbeyoğlu
Hatice Ülkü Osmanbeyoğlu, Pittsburgh Üniversitesi Tıp Okulu’nda Biyomedikal Bilişim Bölümü ve UPMC Hillman Kanser Merkezi’nde Yardımcı Doçenttir. Araştırmaları, kişiselleştirilmiş kanser tedavilerinin geliştirilmesine yardımcı olmak için hastalık mekanizmalarını anlamaya yönelik veri odaklı hesaplamalı yaklaşımlar geliştirmeye odaklanmaktadır. Pittsburgh Üniversitesi’nden Biyomedikal Bilişim alanında doktora derecesine sahiptir.
Özet
Uzmanlaşmış hücre tiplerinin kimliği ve işlevleri, sinyalleşme ve transkripsiyon ağları arasındaki karmaşık etkileşime bağlıdır. CITE-seq gibi tek hücre teknolojileri, hücre yüzey reseptör ekspresyonunun transkripsiyonel durumlarla eş zamanlı nicel analizine olanak tanır. SPaRTAN’ı (Tek Hücreli Proteomik ve RNA tabanlı Transkripsiyon Faktörü Aktivite Ağı) sunuyoruz. SPaRTAN, CITE-seq veri setlerini cis-düzenleyici bilgilerle birleştirerek hücre yüzey reseptörlerini transkripsiyon faktörleriyle ilişkilendiren bir hesaplamalı yöntemdir. SPaRTAN, tümör infiltre eden CD8+ T hücrelerinin sinyalleşmeyle eşleşmiş TF durumlarını tahmin etmek için uygulanmaktadır.
Tarih: 11 Haziran, 2021 – 7:00 PM (GMT+3)
Dil: İngilizce