Webinar Hakkında
Sunucu
Özge Gizlenci
Özge Gizlenci, Türkiye’deki Orta Doğu Teknik Üniversitesi’nden Moleküler Biyoloji ve Genetik alanında lisans derecesini aldı. Ardından, Heidelberg Üniversitesi’nde Kanser Biyolojisi alanında uzmanlaşarak Moleküler Biyobilimler yüksek lisans derecesine devam etti. Ekim 2018’de, Avrupa Birliği’nin Horizon 2020 araştırma ve inovasyon programının COSMIC konsorsiyumu kapsamında Marie Skłodowska-Curie Hareketliliği tarafından finanse edilen Babraham Enstitüsü’nün İmmünoloji Programı’nda doktora pozisyonuna başladı. Dr. Martin Turner ile yürüttüğü doktora projesi, uzun okuma yeni nesil dizileme teknolojileri kullanarak germinal merkezde B hücrelerindeki gen ekspresyonu ve alternatif ekson dizilimi değişikliklerini anlamaya odaklanmaktadır.
Özet
Alternatif ekson dizilimi (AS), bağışıklık yanıtı sırasında bağışıklık hücrelerinin farklılaşmasında önemli bir rol oynar çünkü AS genlerinin %29’u bağışıklık sistemine özeldir. İnsan germinal merkez B hücrelerinin hem gen hem de izoform seviyelerinde transkripsiyon sonrası düzenlemeyi anlamak için uzun okuma teknolojisi, Oxford Nanopore Technologies (ONT) iş akışını geliştirmeyi amaçladık. Farklı ekson dizilim varyantlarını belirlemek için ‘Nexons’ adlı bir iş akışı geliştirdik. Nexons ile yapılan derinlemesine bir ekson dizilim düzenleyicileri analizi, aktivasyon üzerine ekson dizilim faktörlerinin (örneğin SRSF3) zehirli eksonlarının tercihli olarak çıkarıldığını ortaya çıkardı.
Tarih: 20 Mayıs, 2022 – 10:30 AM (GMT+3)
Dil: İngilizce