Webinar Hakkında
Sunucu
Bilgenur Baloğlu
Bilgenur Baloglu, Istanbul Teknik Üniversitesi’nde moleküler biyoloji ve genetik alanında B.S. derecesi aldı. Ardından 2018 yılında Singapur Ulusal Üniversitesi’nden Biyolojik Bilimler alanında doktora derecesi aldı. Tezi, DNA dizileme teknolojilerini kullanarak sucul habitatların biyolojik değerlendirmesine odaklandı. Şu anda Kanada’daki Guelph Üniversitesi Biyoçeşitlilik Genomiği Merkezi’nde doktora sonrası araştırmacı olarak görev yapıyor.
Özet
Metabarkodlama (bir çevre örneğinde bulunan bitki, hayvan ve mantar taksonlarının tanımlanması) ekoloji, gıda güvenliği, zararlı tanımlama ve hastalık gözetiminde hızla önem kazanmaktadır. Oxford Nanopore dizileme platformları uzun okumalar sağlamasına rağmen yüksek hata oranlarıyla (~%12-15) sınırlıdır. Tatlı su sahte topluluğu kullanarak, döngüsel daire amplifikasyon protokolüyle birleştirilmiş Oxford Nanopore MinION’ın kapasitesini test ettik ve %99’dan fazla ortalama dizi doğruluğu elde ettik. Ayrıca ASHURE adlı yeni bir Python pipeline öneriyoruz.
Tarih: 28 Ağustos, 2020 – 3:00 pm (GMT+3)
Dil: İngilizce