Webinar Hakkında
Sunucu
Cansu Dinçer
Özet
Bir hücrenin uygunluğu için gerekli olan genleri tanımlayan büyük ölçekli genetik taramalardan ortaya çıkan bir tema, belirli bir genin esansiyalitesinin oldukça bağlama özgü olduğu ve bir dizi genetik ve çevresel faktöre bağlı olduğudur. Bu bağlamların tanımlanması, genin işlevini tanımlamanın ve yeni terapötik müdahaleler geliştirmenin anahtarı olabilir. Burada CEN-tools’u (Bağlama Özgü Esansiyallik Ağı-araçları) sunuyoruz; kullanıcıların büyük ölçekli genomik CRISPR taramalarından elde edilen verilerle bir genin esansiyalitesini sorgulamalarına olanak tanıyan bir web sitesi ve eşlik eden bir python paketi. CEN-tools’un hem sistematik genetik bağımlılıkların tanımlanması hem de spesifik kullanıcı tarafından seçilen genlerin bağımlılıklarına yönelik hedefli sorgular için uygun olduğunu gösteriyoruz. CEN-tools içindeki genler ve belirli bir bağlam arasındaki ilişkiler, bağımlılık ağları (CEN’ler) olarak temsil edilmekte ve bu ağların yeni gen işlevlerinin aydınlatılmasındaki faydasını gösteriyoruz. Ek olarak, bağımlılık ağlarını mevcut protein-protein etkileşim ağlarıyla entegre ederek kanser hücrelerinde bağlama bağımlı temel hücresel yolakları ortaya çıkarmaktayız.
Tarih: 27 Şubat, 2021 – 6:00 pm (GMT+3)
Dil: İngilizce