Webinar Hakkında
Sunucu
Dr. Öğr. Üyesi Şebnem Eşsiz, Kadir Has Üniversitesi
Özet
Bu konuşma, homoloji modellemesi ile kaba taneli moleküler dinamik çalışmalarını ve protein yapısı öngörü tekniklerinden devralınan zorlukların ligand kapılı iyon kanallarına uygulanmasını, gelişmiş MD simülasyonları ve normal mod analiziyle birlikte ele alıyor.
Düşük dizi benzerliği aralığındaki homolog proteinlerden türetilen karşılaştırmalı modellerin doğruluğu, büyük ölçüde hizalamadaki hatalarla sınırlanıyor. Hizalama yöntemlerindeki ilerlemelere rağmen doğruluk hâlâ zorlu bir mesele. Konuşma, standart modelleme tekniklerinin yanı sıra model kurma ve model değerlendirmenin yinelemeli yaklaşımlarını kapsıyor; tüm atom MD araştırmalarının bugünkü durumunu göstermek için NMDA tetramerik ve nikotinik asetilkolin pentamerik iyon kanalı proteinleri üzerindeki moleküler dinamik çalışmaları kullanılıyor.
Tarih: 15 Nisan 2019 – 17:00 (İstanbul)